建院以来，医院负责人为院长（文革期间为革委会主任）。名录如下：
姓名 | 任职起讫年月 | 备注 |
达保罗 （美国人） | 1910.10～1925.6 | 广东公医学堂附设公医院/广东新公医院 |
李奉藻 | 1925.6～1926.10 | 国立广东大学医科附属第一医院 |
陈元喜 | 1926.10～1928春 | 国立中山大学第一医院 |
柏尔诺阿 （德国人） | 1928春～1928夏 | |
翁之龙 | 1928夏～1931夏 | |
陈翼平 | 1931夏～1932春 | |
李达潮 | 1932春～1932秋 | |
欧阳慧聪 | 1932秋～1933夏 | |
柏尔诺阿（德国人） | 1933.7～1934.7 | |
彭玉书 | 1934.7～1935.1 | |
姚碧澄 | 1935.2～1939.7 | |
叶少芙 | 1939.7～1940.6 | 国立中山大学医学院附属医院 |
张梦石 | 1940.7～1941.9 | |
李雨生 | 1941.10～1945.4 | |
罗 潜 | 1945.4～1945.12 | |
黄榕增 | 1946.1～1947.7 | |
陈翼平 | 1947.8～1948.3 | |
张梦石 | 1948.3～1949.6 | |
刘 璟 | 1949.7～1950.12 | |
李士梅 | 1951.1～1951.3 | |
柯 麟 | 1951.3～1953.8 | 1951年9月，改称中山大学医学院附属医院 1953年4月1日起，医院由中央卫生部直接领导 |
1953.8～1955.6 | 1953年8月，改称华南医学院第一医院 | |
王季甫 | 1955.6～1965春 | 代院长 1955年7月，改称华南医学院附属第一医院 1956年9月，改称广州医学院附属第一医院 1957年3月，改称中山医学院第一附属医院 |
刘志明 | 1965.9～1966.8 | 中山医学院第一附属医院 院长 |
1966.8～1968.9，文革期间，院长空缺，尚无资料确认当时的医院负责人 1968年9月26日，成立中山医学院第一附属医院革命委员会（简称革委会） | ||
刘展羽 | 1968.9～1969.10 | 革委会主任 |
张成林 | 1969～1973.6 | |
车殿均 | 1973.6～1976.1 | |
冯 焰 | 1976.1～1980.7 | |
李士梅 | 1980.9～1984.8 | 中山医学院第一附属医院 院长 |
张秀俊 | 1984.8～1987.8 | 1985年6月，改称中山医科大学附属第一医院 |
肖官惠 | 1987.8～1994.5 | |
黄洁夫 | 1994.5～1998.3 | |
詹文华 | 1998.3～2000.6 | 常务副院长 主持工作 |
詹文华 | 2000.6～2004.12 | 2001年10月，改称中山大学附属第一医院，沿用至今 |
王深明 | 2004.12～2015.1 | |
肖海鹏 | 2015.1～今 | 中山大学附属第一医院院长、党委书记 |
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